持续使用农药会导致昆虫和微生物种群大量减少，产生抗农药害虫，并对“捕食者-猎物”关系产生不利影响。新烟碱类杀虫剂是世界上使用最广泛的杀虫剂之一，这种杀虫剂会影响雄性蜜蜂的精子数量，减少蜂王的数量，近来大黄蜂群落的减少也可能与之有关。